Fastqc 官网
一、安装
1 conda 安装 Fastqc
conda install fastqc2 sudo 权限直接安装
sudo apt install fastqc3 下载安装
Windows/Liunx 下载链接
Mac 下载链接
二、使用
fastqc -o outdir -t 16 fastq1 fastq2 ...主要参数：
-o --outdir # FastQC 生成的报告文件的储存路径，生成的报告的文件名是根据输入来定的
-t --threads # 选择程序运行的线程数，
-q --quiet # 安静运行模式，一般不选这个选项的时候，程序会实时报告运行的状况运行结束后生成两个文件一个.html网页文件，一个是.zip压缩文件。
使用浏览器打开html文件：
